Placée sous l’autorité de la direction générale adjointe en charge de l’aménagement, de l’infrastructure et de l’environnement (DGA AIE), l’unité technique de gestion du FED est composée de cinq agents :
| | Ordonnateur territorial du FED Président du Conseil général de Mayotte | |
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| | Ordonnateur territorial suppléant du FED Direction générale des services (DGS) | |
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| | Ordonnateur territorial suppléant du FED DGA AIE | |
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| | Assistance Technique | Unité technique de gestion du FED | |
| BRLi | Chargée de projets ruraux (Régisseur UTG, Régisseur suppléant GEP) |
| Chargé de projets urbains (Régisseur GEP, Régisseur suppléant UTG) |
| Chargée de projets Communication |
| Comptable (Comptable UTG, Comptable GEP) |